Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBFA2T2O43439 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms