Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VGFO15240 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VGFO15240 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VGFO15240 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VGFO15240 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VGFO15240 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VGFO15240 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms