Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPATO15228 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPATO15228 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPATO15228 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPATO15228 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNPATO15228 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNPATO15228 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms