Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2SURPO15042 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms