Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KPNA3O00505 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms