Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms