Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E9PBE3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E9PBE3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E9PBE3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E9PBE3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms