Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf58C9J3I9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms