Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms