Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms