Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms