Protein–RNA interactions for Protein: A6NMZ7

COL6A6, Collagen alpha-6(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 2,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A6A6NMZ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A6A6NMZ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms