Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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TMEM200CA6NKL6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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TMEM200CA6NKL6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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