Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms