Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms