Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y608

LRRFIP2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP2Q9Y608 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRFIP2Q9Y608 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms