Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX9Q9Y5X1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX9Q9Y5X1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms