Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms