Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms