Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRXN3Q9Y4C0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms