Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHDC2Q9Y2U9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms