Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms