Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF2Q9UNY4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms