Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms