Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PALD1Q9ULE6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms