Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRTO4Q9UKD2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms