Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTI1BQ9UEU0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms