Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REREQ9P2R6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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