Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms