Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms