Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCHIP1Q9P0W5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms