Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CMTM6Q9NX76 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CMTM6Q9NX76 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms