Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms