Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms