Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms