Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPHS2Q9NP85 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPHS2Q9NP85 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPHS2Q9NP85 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPHS2Q9NP85 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms