Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms