Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms