Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC2Q9C0B9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms