Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms