Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms