Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM55Q9BYV6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms