Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms