Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPERQ9BY12 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPERQ9BY12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms