Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF17Q9BXT8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms