Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNG6Q9BXT2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms