Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL3Q9BXA9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms