Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms