Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms