Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MGME1Q9BQP7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms